Schijven kunnen worden ingesteld met verschillende bestandssystemen en elk bestandssysteem heeft voor- en nadelen. De tabel hieronder bevat een aantal van deze voor- en nadelen.
| Bestandssystemen | |||||
| NTFS | Apple File System (APFS) | MacOS Extended Journaled (HFS+) | exFAT | FAT32 (MS-DOS) | |
| Voordelen: | Systeemeigen in Windows | Systeemeigen in macOS | Systeemeigen in macOS | Kan worden gebruikt tussen Mac en Windows | Kan worden gebruikt tussen Mac en Windows |
| Biedt ondersteuning voor Journaling | Houdt machtigingen bij | Biedt ondersteuning voor Journaling | Niet langer beperkt tot bestanden van 4 GB of minder | ||
| Houdt machtigingen bij | Standaardbestandssysteem voor Time Machine voor macOS 11 Big Sur en recentere versies. | Houdt machtigingen bij | |||
| Ondersteund op oudere versies van macOS 10.6 tot huidige versie. | |||||
| Standaardbestandssysteem voor Time Machine voor macOS 10.15 Catalina en eerdere versies. | |||||
| Nadelen: | Schrijfbeveiligd op Mac-besturingssystemen (kan worden opgelost met NTFS-stuurprogramma) | Wordt niet gekoppeld op Windows-computer | Wordt niet gekoppeld op Windows-computer (kan worden opgelost met HFS+-stuurprogramma) | Detecteert resource en data forks niet correct (potentieel risico bij schakelen tussen Mac en Windows) | Maximale grootte van 4 GB voor afzonderlijke bestanden |
| Werkt niet met Time Machine | Niet ondersteund op oudere versies van macOS. APFS wordt niet ondersteund in macOS 10.12 of eerdere versies. | Bij gebruik met Time Machine wordt de schijf beveiligd tegen schrijven (alleen-lezen). Meer informatie vindt u in dit artikel. | Werkt niet met File History (Bestandshistorie) of Time Machine | Detecteert resource en data forks niet correct (potentieel risico bij schakelen tussen Mac en Windows) | |
| Bij gebruik met Time Machine wordt de schijf alleen-lezen. | Stuurprogramma vereist voor Windows XP | Werkt niet met File History (Bestandshistorie) of Time Machine | |||
| Houdt bestandsmachtigingen niet bij | Houdt bestandsmachtigingen niet bij | ||||
