個案研究

日本基因遺傳學公司選用 CORVAULT

GeneBay 是專精於基因遺傳研究的日本中小企業,由於需要管理龐大的生物分析庫目錄,同時也不願放棄效能及維護管理的便利性,而轉向 Seagate 尋求經濟實惠的儲存解決方案。

14 7月, 2023

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    個案研究CORVAULT備份及還原

    簡介

    GeneBay, Inc. (https://genebay.co.jp) 於 2016 年創立於橫濱,運用次世代的定序和設計技術,提供尖端的「組學」(基因組和轉錄組) 分析服務,並開發組學分析相關的軟體系統。GeneBay 也與多家定序公司合作提供分析服務,其中不乏國外知名公司。

    他們的故事

    GeneBay 的客戶集中於學術界,主要為大學以及私人和公家研究機構,針對人用藥物和生物學的研究和開發工作提供分析服務。近期對植物、動物和魚類等人類以外的生物物種,該領域在 DNA 分析方面的需求有所上升。

    GeneBay 自創立以來,執行過二級和三級分析的定序器資料研究,也開發過多個資料庫,並且建立起分析系統。該公司持續為客戶提供上述服務,範圍涵蓋生物學研究的各大層面,甚至更廣。

    GeneBay 營運長 Kensaku Imai

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    他們的目標

    GeneBay 深知自身的生物分析服務資料傳輸率在穩定提升。縱使最初採用的資料儲存解決方案越來越難以管理,他們還是努力達成每個客戶互不相同的需求。該公司的挑戰在於尋找合適的儲存基礎結構,不但必須具備充足的空間和速度,還得易於使用,而且符合中小企業的預算。

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    他們所遭遇的問題

    GeneBay 的業務自 1996 年起便穩定成長。該公司一開始使用的是自家技術人員所裝設的 NAS 儲存系統,最初只有一部裝置,而逐漸擴大到總共十台設備。此時公司人員認為此種配置已經難以管理,而且也懷疑能否及時加入足夠的儲存裝置,以便應對日漸增長的資料需求。 

    GeneBay 營運長 Kensaku Imai 在先前任職的公司有接觸大量儲存裝置的經驗,但認為許多選擇都太過昂貴。雖說存取速度相當重要,但首要之務是找到能容納該公司大量資料的解決方案。

    為了更清楚解釋生物分析資料的儲存需求,Imai 以人類 DNA 舉例說明。讀取人類的 DNA 序列平均需要 33 個點,也就是 3GB。但若想達到更高的準確度,就需要更多樣本,因此這些數字會隨之暴增。分析的方式也會影響到建立的資料量。對一份人類 DNA 樣本採用長讀取定序,便會產生大約 2TB 的資料量。若 GeneBay 想要精準讀取 500 份樣本,儲存容量一下就會達到 PB 規模。

    儘管客戶對樣本的需求變化多端,資料量和分析工作的規模在過去兩年間已顯見大幅成長。

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    他們的解決方案

    Imai 表示:「想找到低開銷的解決方案很難。當我注意到 Seagate Exos CORVAULT 時,覺得這看起來能以較低的成本提供大容量。」 

    GeneBay 與加值供應商 ASK 合作,認定 Seagate 解決方案正好符合需求。該公司既想要獲得經濟實惠的大容量解決方案,也希望供應商能協助他們申請日本的中小企業 (SME) 賦稅系統。Imai 提到,若中小企業投資新設備用以改善公司生產力,且改善程度與先前模式相比每年平均超過 1% (例如生產效率、精確度、能源效率等),該系統便會提供稅金優惠 (稅金減免)。若要申請,製造商必須在購買前先向中小企業核發證書,證明該設備符合生產力提升的條件。

    GeneBay 一開始合作的技術供應商拒絕處理此類申請,表示申請流程如今已太過複雜。但 Seagate 同意協助,並且讓 GeneBay 成功申請到稅金優惠。由於這屬於持續性的優惠,Imai 預計將來再次購買 Seagate 解決方案時也會再次申請。

    在購買之前,Imai 已經相當瞭解先前 Exos CORVAULT 搭配 Seagate 的 Autonomic Distributed Allocation Protection Technology (ADAPT) 的模式。GeneBay 的採購決策下達之時,所提供的產品是新一代的 Exos CORVAULT,如此 ADAPT 能與多種簡單方便且相對低成本的獨家功能相互連接,Imai 對此特別滿意。

    Seagate Exos CORVAULT 協助 GeneBay 簡化了資料工作流程。首先,連接至 NAS 系統的 DNA 定序器會將資料傳送到 GeneBay 的 10GB 網路以供儲存。資料儲存到新的 CORVAULT 架構後,專用的分析伺服器會解析資料,並將資料準備妥當,以便透過 USB、外接式 HDD 或公用雲端傳送給客戶。

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    他們的成功經驗

    GeneBay 使用 Exos CORVAULT 的前三個月,資料的儲存量來到 735TB。公司員工如今可以安心接受「需要處理龐大資料的特大型專案」。

    Imai 表示:「若沒有採用 CORVAULT,我們根本無法接下這種專案。」

    Imai 和同事也很感謝 Seagate 提供解決方案的飛快速度。裝設流程只花了 6 個月。10 月展開討論,產品在 3 月便送到。這段過渡期間讓 GeneBay 成功申請到中小型企業稅金獎勵。該公司表示 Exos CORVAULT 系統「穩定、快速而且容易管理」,這對資源有限的中小企業而言是重要的優勢。

    GeneBay 也達成了最初的目標:應對成長中的資料需求,並且回應每位客戶所要求的分析作業量。Imai 認為在缺少合適架構的狀況下,GeneBay 可能在這三個月內就得拒絕掉數個價值上千萬日圓的案子。

    無論需要刪除多少資料,Imai 都希望避免發生儲存資源耗盡的情形。他雖然期望 GeneBay 的資料分析工作持續成長,但若未訂定更為全方面的行動計畫,他對於是否要增加更多容量也是舉棋難定,因為增加容量還要考慮到電費等額外因素。但當時機來臨,Imai 表示 GeneBay 很樂意再度考慮向 Seagate 尋求合作。

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    我們的儲存容量向來相當分散又各自獨立,儲存空間耗盡一直是我擔憂的問題。如今 Exos CORVAULT 已經讓這個煩惱煙消雲散,我對此十分感激。

    Kensaku Imai

    GeneBay 營運長 

     相關資源

    系統
    Exos CORVAULT
    Seagate Exos® CORVAULT 是高效能的區塊儲存系統,具備 PB 級容量、99.999% 的可用性、超大規模等級的效率,以及突破性的自我修復永續型技術。

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    我們的儲存裝置專家隨時樂意提供協助,幫您找出最適合的解決方案,因應您面對的種種資料難題。