Hard disk dapat dikonfigurasi dengan berbagai sistem file dan setiap sistem file memiliki kelebihan dan kekurangan. Berikut adalah daftar yang mencakup beberapa kelebihan dan kekurangan.
| Sistem File | |||||
| NTFS | Apple File System (APFS) | MacOS Extended Journaled (HFS+) | exFAT | FAT32 (MS-DOS) | |
| Kelebihan: | Asli untuk Windows | Asli untuk macOS | Asli untuk macOS | Dapat digunakan di antara Mac dan Windows | Dapat digunakan di antara Mac dan Windows |
| Mendukung Pembuatan Jurnal | Terus melacak izin | Mendukung Pembuatan Jurnal | Tidak lagi terbatas pada file 4 GB atau kurang | ||
| Terus melacak izin | Sistem file default untuk Time Machine pada macOS 11 Big Sur dan versi lebih baru. | Terus melacak izin | |||
| Didukung di versi lama macOS 10.6 hingga versi saat ini. | |||||
| Sistem file default untuk Time Machine pada macOS 10.15 Catalina dan versi sebelumnya. | |||||
| Kekurangan: | Penulisan terkunci pada sistem operasi Mac (dapat diatasi dengan driver NTFS) | Tidak dapat dipasang pada komputer Windows | Tidak dapat dipasang pada komputer Windows (dapat diatasi dengan driver HFS+) | Tidak melihat pembagian sumber daya dan data dengan benar (Berpotensi risiko saat beralih antara Mac dan Windows) | Batas ukuran 4 GB untuk satu file |
| Tidak berfungsi dengan Time Machine | Tidak didukung pada versi lama macOS. APFS tidak didukung pada macOS 10.12 atau versi sebelumnya. | Bila digunakan dengan Time Machine, hard disk menjadi terkunci untuk penulisan (hanya baca). Informasi lebih lanjut dapat ditemukan di artikel ini. | Tidak berfungsi dengan Riwayat File atau Time Machine | Tidak melihat pembagian sumber daya dan data dengan benar (Berpotensi risiko saat beralih antara Mac dan Windows) | |
| Bila digunakan dengan Time Machine, hard disk menjadi hanya baca. | Memerlukan driver untuk Windows XP | Tidak berfungsi dengan Riwayat File atau Time Machine | |||
| Tidak melacak izin file secara terus-menerus | Tidak melacak izin file secara terus-menerus | ||||
